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PGC1基因Thr394Thr多态性与Ⅱ型糖尿病关系的研究
作者:佚名  来源:本站整理  发布时间:2008-1-3 6:45:18

作者:张子波
作者单位:延边大学基础医学院 细胞生物学与医学遗传学教研室,吉

林 延吉 133000
《延边大学医学学报》2007年12月30卷4期 实验研究
        【摘要】  探讨延边地区朝鲜族及汉族人群PGC1

基因Thr394Thr多态性与Ⅱ型糖尿病的相关性.[方法]采用聚合酶链反

应单链构象多态性(PCRSSCP)方法对104例糖耐量正常者和113例

Ⅱ型糖尿病患者的PGC1基因Thr394Thr多态性基因型进行对照研究.[

结果]朝鲜族和汉族正常人PGC1基因Thr394Thr多态性的A等位基因频

率分别为23.3%,20.7%;糖耐量正常组及Ⅱ型糖尿病组人群的PGC1基

因Thr394Thr多态性的A等位基因频率均为22.1%.[结论]延边地区朝鲜

族和汉族人群PGC1基因Thr394Thr多态性间无显著性差异;PGC1基

因Thr394Thr多态性与Ⅱ型糖尿病发病无相关性.

【关键词】  多态性 单核苷酸 糖尿病 Ⅱ型 人种群

    Study on relationship of PGC1 gene Thr394Thr

polymorphism and type 2 diabetes mellitus

    ZHANG Zibo1, L Fuqing2, WANG Weijie3, LI Bo1,

 YANG Kangjuan1, JIN Yuanzhe4

    (1.Department of Cell Biology and Medical Genetics,

Yanbian University College of Basic Medicine, Yanji 133000;

2.Department of Internal Medicine, Dunhua City Hospital,

Dunhua 133700;3.Department of Hormonology, Hunchun City

Hospital, Hunchun 133300;4.Department of Physiology and

Pathophysiology, Yanbian University College of Basic Medicine,

Yanji 133000:Jilin, China)

    ABSTRACT:OBJECTIVETo determine the correlation of

peroxisome proliferators activated receptorγ coactivator 1

(PGC1) gene Thr394Thr polymorphism and type 2 diabetes

mellitus (T2DM) for KoreanChinese and Han nationality in

Yanbian area.METHODSPGC1 gene Thr394Thr polymorphism in 104

cases of normal glucose tolerant (NGT) and 113 cases of T2DM

was detected by PCRSSCP.RESULTSThe A allele frequencies of

NGT in KoreanChinese and Han nationality were 23.3% and

20.7%, respectively, and there was no significant difference

between two groups. The A allele frequencies of NGT and T2DM

subjects were all of 22.1%.CONCLUSIONThere was no difference

in frequency distribution of PGC1 gene Thr394Thr

polymorphism between KoreanChinese and Han nationality in

Yanbian area, and the PGC1 gene Thr394Thr polymorphism was

not associated with T2DM.

    Key words:polymorphism, single nucleotide;diabates

mellitus, type2;ethnic groups

    过氧化物酶体增殖受体γ辅激活因子1(peroxisme proliferator

activated receptouγ,  PGC1)是新颖的核受体家族的转录共

激活蛋白,是过氧化物酶体增殖物受体γ(PPARγ)的转录辅激活因

子[1].该基因定位于人类染色体4p15.1,全长为6kbp,由13个外显子

和12个内含子组成[2].PGC1对体内能量代谢有调控作用,提示它可

能与肥胖、Ⅱ型糖尿病及脂代谢密切相关.本研究应用聚合酶链反应

单链构象多态性(PCRSSCP)技术探讨了延边地区朝鲜族及汉族人群

PGC1基因Thr394Thr多态性与Ⅱ型糖尿病的关系.

    1  对象与方法

    1.1  对象  在吉林省延边地区,遵循自愿知情的原则随机选择217

名被调查者,对象间均无血缘关系,且双亲连续三代均为同一民族.Ⅱ

型糖尿病的诊断参照1999年世界卫生组织(WHO)制定的Ⅱ型糖尿病诊

断标准进行.研究对象中糖耐量正常者为104名,列入糖耐量正常组

(NGT),其中朝鲜族为46人,男女比例为100∶96,年龄为31~63岁,汉

族为58人,男女比例为100∶106,年龄为32~60岁;Ⅱ型糖尿病者为

113名,列入为Ⅱ型糖尿病组(T2DM),其中朝鲜族为48人,男女比例为

100∶104,年龄为45~66岁,汉族为65人,男女比例为100∶109,年龄

为46~67岁.

    1.2  方法

    1.2.1  人类基因组DNA的提取及鉴定  取酸性枸橼酸葡萄糖(ACD

)抗凝全血3mL,置于-80℃冰箱冻存.基因组DNA的提取严格按照小量全

血DNA提取试剂盒(由北京华美生物工程公司提供)说明书步骤进行操

作,4℃条件下保存.利用DNA/RNA蛋白测定仪测定DNA纯度.结果示所有

被检样品质量浓度均在200mg/L以上;OD260nm/OD280nm比值大于1.6,

提示DNA纯度良好.

    1.2.2  PCR扩增  PCR反应总体积为25μL,引物序列为,上游引物

5′TGGTGGACACGAGGAAAG3′,下游引物5′

CTGCCAATCAGAGGAGACAT3′;扩增片段大小为166bp,模板DNA为100ng

,dNTP为200μmol/L,上游引物及下游引物质量浓度均为12.5pmol/L,

TaqDNA聚合酶为1U,扩增循环参数为95℃变性45s,56℃退火45s,72℃

延伸45s,共30个循环,循环前反应液95℃预变性3min,最后72℃延伸

10min.反应在PCPersonal Cycler (Biometra) PCR扩增仪上进行,所

用试剂均为北京华美生物工程有限公司产品.

    1.2.3  SSCP检测  取PCR扩增产物8μL,加入2μL变性剂(950g/L

甲酰胺,10mmol/L EDTA,0.2g/L溴酚蓝),98℃加热变性10min,取出

后立即放入冰浴中2min以上.在4℃条件下,将全部水相上样于12g/L非

变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)上,在300V条件下电泳8h,取出凝胶行银

染,观察显示条带情况.

    1.2.4  DNA序列测定  选取SSCP结果具有代表性的PCR产物3份进行

DNA序列测定,以确保SSCP结果判读的正确性.

    1.2.5  统计学处理  运用基因计数法计算基因型频率和等位基因

频率,利用HardyWeinberg遗传平衡定律检验研究样本的群体代表性.

所有统计运算均在SPSS11.1统计软件中进行,两组间基因型及等位基因

频率比较采用χ2检验进行.

    2  结果

    2.1  PCR扩增  琼脂糖凝胶电泳检测结果示,目的片断长度为

166bp,与理论设计相符(图1).

    图1  琼脂糖凝胶电泳PCR扩增产物显示图2.2  SSCP检测  SSCP电

泳检测结果结合序列报告分析显示,所检测的基因型组配形式如下:位

置偏下的2条带示纯合野生型GG;位置偏上的2条带示纯合突变型AA;3

条异常带

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